А до какой степени безопасны программы типа Huaway
 

Для ввода NCK кода в модемы Huawei предлагается программа типа Huawei_modem_code-Writer http://www.gsmforum.su/showthread.php?t=51936 и несколько её клонов.

До какой степени корректно отработает эта программа или безопаснее использовать Гипертерминал и вводить вручную команду AT^CARDLOCK=код NCK?

Иначе говоря, эти многочисленные программы используют тот же набор команд, что и Гипертерминал, или они пишутся напрямую в некие ячейки модема, которые теоретически у разных модемов(особенно очень новых) могут располагаться по разным адресам?

Если правильно определяет модем, то можно пользоваться. В ином случае - нет. Так же как и АТ команды могут различаться.